日本馆的参展主题为“心之和·技之和”，所要传递的核心信息为“联接起来！为了和美的未来”。世博会吉祥物(海宝)通过“过去”展区的遣唐使，西阵织等中国文化、技术在日本传承的展示；烟囱拆除“现在”展区的动漫、机器人等技术和影像的展示；“未来”展区的音乐剧等表演，用“技之和”解决人类面临的环境问题，来达到“心之和”。3个展区参观时间约为1小时，可容纳1500人参观。而日本馆的主题将通过拯救“东方宝石”朱鹮的故事完美演绎出来，中日两国人民通过环境保护和共同努力，使日本又重归西天。